Балдырган Кожамкулова родилась 30 марта 1930 года в Алматы в семье выдающихся представителей казахского театрального искусства — народного артиста СССР и Казахстана Сералы Кожамкулова и актрисы Хадиши Кожамкуловой. Творческая атмосфера в семье, образ жизни, тесно связанный со сценой и искусством, с ранних лет сформировали у Балдырган эстетический вкус. Об этом свидетельствовали и ее музыкальные способности, проявившиеся еще в детстве, и занятия игрой на фортепиано. Родители связывали будущее дочери с искусством и надеялись, что она станет профессиональным музыкантом. Однако саму Балдырган все больше привлекала не сцена, а загадочный мир природы и история, сохранившаяся в земных недрах. Окаменевшие кости, следы древних живых организмов, размышления о времени и пространстве волновали ее с самого раннего возраста. Именно этот интерес и привел ее от искусства к науке. Она осознанно выбрала биологию и в 1949–1954 годах обучалась на биологическом факультете Казахского национального университета, ныне носящего имя аль-Фараби. Для того времени такой выбор был особенно смелым шагом. Ведь в середине XX века женщины в науке, особенно в такой сложной и трудоемкой области, как палеонтология, встречались крайне редко. Тем не менее Балдырган Сералиевна осталась верна своим интересам и избрала научный путь.

В 1954–1957 годах Балдырган Сералиевна обучалась в аспирантуре Института зоологии Академии наук Казахской ССР, где работала под научным руководством В. С. Бажанова — одного из первых исследователей, внесших вклад в становление палеозоологии в Казахстане. Эти годы стали решающим этапом, определившим профессиональную судьбу молодого ученого. Полевые экспедиции, систематизация ископаемых материалов, сравнительный анализ костных останков древних животных и другие сложные исследовательские работы стали неотъемлемой частью ее повседневной научной деятельности. Именно в этот период Балдырган Кожамкулова начала рассматривать окаменевшие кости не просто как биологические объекты, а как источники сведений, способные «рассказать» историю Земли, и окончательно выбрала палеонтологию делом своей жизни. Известно, что ее отец, поначалу с сомнением относившийся к выбору дочерью столь сложной и трудоемкой научной специальности, обратился за разъяснением ее значения к Канышу Сатпаеву — признанному лидеру казахской науки того времени. Академик Каныш Имантаевич особо подчеркнул историческую значимость выбора Балдырган, отметив, что палеонтология является исключительно важным и перспективным научным направлением, необходимым стране. Он поддержал стремление молодого ученого и обосновал решающую роль подобных исследований в познании природной истории Казахстана. Последующие годы полностью подтвердили справедливость его слов. Благодаря преданности науке и настойчивости Балдырган Сералиевны палеонтология в Казахстане сформировалась как самостоятельная научная дисциплина и стала одним из важнейших направлений отечественной науки.

В 1957 году аспирантка Балдырган Кожамкулова была направлена в составе научной экспедиции к месту палеонтологических раскопок Каскыр жалы (Волчья Грива), расположенному на территории Западной Сибири. Эта поездка стала одним из поворотных моментов в научной биографии молодой исследовательницы. Первоначально найденные во время раскопок останки предположительно были определены как птичьи кости, однако тщательный сравнительный анализ, проведенный Балдырган Кожамкуловой, доказал, что в действительности они представляли собой корни зубов мамонта. После этого открытия масштабы раскопок были расширены, и на протяжении почти месяца проводились систематические исследования. В результате из земных недр было извлечено более трех тонн ископаемого костного материала, который впоследствии был введен в научный оборот. В ходе экспедиции были обнаружены кости, принадлежавшие самцу, самке и двум детенышам мамонта, а также удалось восстановить полный скелет взрослого мамонта, что стало исключительно редкой находкой. Впоследствии этот скелет доставили в Алматы, где он прошел научную обработку. Сегодня он хранится в Музее природы «Ғылым ордасы» и представлен широкой публике как один из наиболее ценных экспонатов, ставших символом палеонтологических исследований в Казахстане.

В 1964 году Балдырган Сералиевна успешно защитила кандидатскую диссертацию на тему «Қазақстанның антропогендік қазба териофаунасына шолу» и вошла в число ведущих специалистов отечественной палеонтологической науки. Благодаря этой работе она осуществила научную систематизацию фауны млекопитающих, обитавших на территории Казахстана в последние геологические эпохи, и заложила основы комплексного анализа палеонтологических данных.

С 1964 по 1986 год Балдырган Кожамкулова возглавляла лабораторию палеобиологии Института зоологии Академии наук Казахской ССР, внеся решающий вклад в становление этой области как самостоятельного научного направления. Именно в этот период палеонтологические исследования в Казахстане перестали носить эпизодический характер и превратились в планомерную, системно развивающуюся отрасль науки. Она успешно сочетала лабораторную работу с полевыми экспедициями, уделяя особое внимание подготовке молодых ученых и совершенствованию научной методологии.

За годы научной деятельности Балдырган Кожамкулова опубликовала более 170 фундаментальных исследований и монографий, значительно обогатив фактическую и научную базу казахстанской палеонтологии. Ее труды стали ценными источниками знаний не только для отечественной науки, но и для международного научного сообщества. Благодаря результатам проведенных ею исследований был научно подтвержден уникальный статус ряда палеонтологических памятников на территории Казахстана, а три крупных палеонтологических заповедника — «Қаздар өткелі», «Әулие» и «Қошқорған» — получили официальное признание и были учреждены в установленном порядке.

Ученая ушла из жизни 14 января 2014 года, на 84-м году жизни. До последних дней она не прекращала научную деятельность, продолжая систематизировать свои труды, посвященные изучению природной истории Казахстана, и консультировать молодых исследователей. Балдырган Сералиевна оставила после себя богатое научное наследие, сформировавшуюся научную школу и прочный фундамент казахстанской палеонтологии.