В 1380-81 году Тохтамыш восстановил мир с генуэзцами. При Тохтамыше Улус Джучи испытал экономический подъем, связанный с централизацией власти и развитием экономики. Он восстановил мир с генуэзцами, обеспечив нормальное развитие торговли с итальянской республикой. Также Тохтамыш попытался вернуть под контроль те улусы, которые перестали подчиняться Золотой орде во времена Замятни. В 1382 году Тохтамыш выдвинулся в поход на русские княжества. Рязанский и Нижегородский князья сразу признали власть хана и снабдили его продовольствием и проводниками. Московский князь отказался приносить присягу и развернул мобилизацию для военного противостояния с Тохтамышем, выехав из Москвы. Тохтамыш смог захватить Москву и ряд других городов. После этого Дмитрий Донской признал власть хана и вынужден был послать в аманаты (заложники) своего старшего сына.

Как пишут летописцы, до 1383 года, в окружении Тохтамыша были осторожные эмиры: Урук-Тимур из рода Ширин, Алибек из рода Кунграт. Но после их смерти, на Тохтамыша стали влиять эмиры Казанчи, другие эмиры из рода Мангыт (возможно Едиге и его брат Исабек), которые были «партией войны» и желали воевать с Тамерланом. В 1383 году Тохтамыш совершил поход на Хорезм, который с 1361 года отпал от Золотой орды и был  фактически независимым владением. В 1379 году Хорезм был покорен Тамерланом. Матерью Тохтамыша была женщина из рода Кунграт, возможно из числа родственников Кунгратской династии Суфи, правившей в Хорезме. Поэтому понятна личная заинтересованность Тохтамыша во владении Хорезмом. Поход на Хорезм 1383 года ставил отношения Тамерлана и Тохтамыша на грань разрыва. В 1384-85 годах, Тохтамыш отправил посольство в Египет, с целью заключения военного союза против Тамерлана. К тому же, очень вероятным был и союз против Тамерлана с турецким султаном. На востоке Тохтамыш заключил союз с могулистанскими правителями Камар ад-Дином дуглатом и Инка-торе против Тамерлана.

Не получив никакой реакции на завоевание Хорезма, Тохтамыш уверился в собственной непобедимости и решил вернуть еще одно владение, на которое претендовали джучиды еще со времен Берке. В 1386 году он вторгся в Ширван. Вначале Ширван был под контролем Тохтамыша, но Тамерлан, находившийся недалеко от этой области, повел войска навстречу Тохтамышу. Тохтамыш, не ожидавший такой реакции, послал сообщение Тамерлану с заверениями о своих мирных намерениях. Тамерлан был удовлетворен формальными извинениями и возвращением области под свой контроль. В 1387 году Тохтамыш опять напал на владения Тамерлана в Средней Азии, в то время как Тамерлан вел военные действия в Иране. Тохтамыш контролировал территорию Азербайджана 2 года, его монеты печатались в Дербенте, Баку, Шемахе в 1387-89 годах. Тамерлан, разозленный столь вероломным поведением Тохтамыша, развернул свои войска в Среднюю Азию. Тохтамыш не решился встретиться в бою с войсками Тамерлана и ушел обратно в Дешти-Кипчак.

В 1387 году другое войско Тохтамыша осадило город Сауран, находящийся на территории современной Южно-Казахстанской области. Некоторые отряды войска Тохтамыша дошли до Ташкента и разграбили его. Армия Тохтамыша осадила Бухару. Тамерлан отослал 30 тысяч воинов на помощь Самарканду, а в феврале 1388 года сам выступил в поход на армию Тохтамыша в Среднюю Азию. Армия Тохтамыша отступила. Тамерлан преследовал ее. Около 1387 года Тимур-Кутлук, один из джучидских принцев поднял восстание против Тохтамыша, но потерпев поражение бежал к Тамерлану. Чуть позже к Тамерлану бежал Едиге из рода мангыт, который был родственником Тимур-Кутлука по женской линии. Едыге был послан Бек-Пуладом и другими заговорщиками, планировавшими свергнуть Тохтамыша. В ответ на набег Тохтамыша, Тамерлан разорил пограничные области и города. Весной 1388 года Тамерлан захватил Ургенч и переселил оттуда людей в Самарканд. С этого момента Ургенч стал терять свое значение. По мнению некоторых историков 1388 год для Ургенча был катастрофичнее, чем разрушения армии Чингиз-хана в 1221 году.

В 1388 году Тохтамыш собрал огромную армию со всей территории Золотой Орды. Помимо кочевников Золотой орды, были мобилизованы русские, черкесы, булгары, аланы, башкиры, Мокша, жители Крыма, Каффы и Азова. Войско Тохтамыша разграбило город Яссы (современный Туркестан). Тамерлан, дождавшись подкреплений, в начале марта 1389 года напал на армию Тохтамыша и разбил ее. Но восстания в Хорасане и Могулистане не позволили Тамерлану развить успех. Тохтамыш, обозленный поражениями, стал наказывать некоторых аристократов. Был убит царевич Хаджи-Баба, трое приближенных Бахыт-ходжа, Кыдыр-ходжа, Мамат-ходжа перебежали на службу московскому князю.

Тамерлан, после агрессивных действий со стороны Тохтамыша решил так или иначе покончить с ним. В 1390 году он собрал большое войско и в феврале 1291 года начал поход на улус Джучи. Проводниками были Тимур-Кутлук и Едыге мангыт. Из дружины Едыге бежало двое нукеров к Тохтамышу и предупредило его о походе. Тохтамыш объявил массовую мобилизацию. Всю первую половину 1391 года войска Тамерлана преодолевали территорию Казахстана, страдая от холода и голода. Тохтамыш к лету не смог собрать все необходимое войско (хотя мобилизованных было очень много), не подошли военные части из Азова, Булгара и других мест. Тохтамыш отошел от места сбора под названием Кырык-коль. Тамерлан подойдя к этому месту захватил в плен азовский военный отряд, который шел на соединение с Тохтамышем. Войско Тохтамыша отступало, надеясь на истощение армии Тамерлана. 18 июня 1391 года войска Тамерлана смогли встретиться с войсками Тохтамыша лицом к лицу в битве на реке Кондурче. Тохтамыш к этому времени не хотел отступать дальше, боясь быть прижатым к реке и быть разгромленным. Войско Тохтамыша воевало традиционным кочевым способом, когда маневренная конница пыталась зайти в тыл врага или обхватить армию врага по флангам. Данный тактический прием назывался Тулгама.

Тамерлан же, знакомый с данными приемами разработал свой метод борьбы с его применением. Он разделил армию на 7 корпусов и оставил резерв. Армия Тохтамыша почти окружила армию Тамерлана, и сам Тамерлан начинал паниковать. Но немного успокоившись Тамерлан начал атаку, которая выправила положение, но еще не склонило чашу весов ни в одну сторону. В итоге предательство царевича Бек-Булада и Ширина Тегини привело к тому, что Тохтамыш, боясь оказаться между двух огней, решил отступить. В битве обе стороны понесли большие потери, Тохтамыш отступил на Запад, а Тамерлан предпочел его не преследовать, так как его армия также понесла огромные потери. Вместо преследования Тамерлан разделил свое войско на мелкие части и занялся разграблением населения Восточного Дешти-Кипчака для сбора провианта и добычи. Без провианта и скота армия Тамерлана вряд ли бы смогла вернуться в целости и сохранности обратно в Среднюю Азию. После этого Тамерлан, стал отступать на юг в свои владения. Едыге и Тимур-Кутлук с позволения Тамерлана, получив ярлыки и охранные грамоты, покинули войско. Они обещали помочь собрать провиант и людей, тем самым помочь вернуться армии Тамерлана домой. Но они не сдержали обещания и Тимур-Кутлук был провозглашен ханом при поддержке Едыге. Безусловно, Тимур-Кутлук контролировал только определенную часть восточного Дешти-Кипчака. Причем Тимур-Кутлук и Едыге использовали охранные грамоты и ярлыки, полученные от Тамерлана, для привлечения под свою защиту людей, опасавшихся новых вторжений Тамерлана. Нарушив клятву Тамерлану, они использовали страх перед его именем для того, чтобы собрать под свои знамена всех колеблющихся. В то время как Кунче, дядя Тимур-Кутлука, отпущенный под такую же клятву, сдержал свое слово и вернулся к Тохтамышу, но узнав о том, что его племянник был провозглашен ханом, Кунче от обиды бежал от Тамерлана к Тохтамышу. В это время Бек-Булад объявил себя ханом в Крыму, но вскоре был разбит Тохтамышем. Отсутствием Тохтамыша воспользовались Едыге и Тимур-Кутлук, которые на время смогли взять Сарай. Тохтамыш в это время постарался наладить отношения с египетским султаном, побуждая его выступить против Тамерлана. Также Тохтамыш вел переговоры с литовским князем Ягайло.

Тамерлан имел большое количество врагов, помимо Тохтамыша, поэтому он предложил Тохтамышу мир. Тохтамыш сначала дал согласие, но потом его эмиры убедили его начать новый раунд войны против Тамерлана. В ответ на письмо Тамерлана Тохтамыш написал письмо с «грубыми выражениями». Получив ответ, Тамерлан разгневался и зимой 1394-1395 года он пошел во второй поход против Тохтамыша, но теперь наученный горьким опытом, он повел войска не по степям мало заселенного Казахстана, где он мог вновь испытать трудности с продовольствием. Тамерлан повел свои войска через Кавказ. Тохтамыш, узнав об этом, испугался и отправил посла с мирными предложениями. Поняв, что война неизбежна, Тохтамыш собрал армию и стал лагерем возле реки Терек. Войско Тамерлана подошло к войску Тохтамыша. 3 дня шли бои только за переправу по реке Терек. 15 апреля 1395 года состоялось сражение между войсками Тамерлана и Тохтамыша. Тохтамыш опять атаковал с флангов. Отряд Кунче-оглана, Бек-Ярык-оглана, Актау, Давуд-Суфи и Утурку напали на левый фланг Тимура. Другой отряд во главе с Исабеком, братом Едыге, Яглыбаем из рода барын (бахрин) и Бакиш-ходжой напал на правый фланг, но этот отряд был разбит. В итоге, часть эмиров Тохтамыша опять предали его: эмир Актау, Бек-Ярык-оглан и будущий крымский хан Таш-Тимур отступили со своими отрядами. Тамерлан разгромил армию Тохтамыша и принялся за систематический грабеж владений Золотой орды. Тохтамыш отступил к Булгару и русским княжествам. Армия Тамерлана стала брать один за другим города Золотой орды. Были взяты поволжские города, города в Крыму и на Кавказе.  Также были взяты и некоторые города русских княжеств, к примеру Елецк в Рязанском княжестве. В итоге были разрушены следующие города: Сарай-Бату (Старый Сарай), Сарай ал-Джадид (Новый Сарай), Бальджимен, Маджар, Азак (Тана, Азов), Солхат, Дядиков.

Перед уходом Тамерлан провозгласил ханом Золотой орды Куйурчака, сына Урус-хана. Разграбив города и совершив несколько грабительских рейдов, Тамерлан покинул территорию Золотой орды. Ущерб, нанесенный Тамерланом, был огромный. После данного периода города Золотой орды не смогли достичь былого величия.

В 1370-80-ых годах на южных маршрутах Великого Шелкового пути под жестким правлением Тамерлана начала устанавливаться политическая стабильность. Война Тамерлана и золотоордынского правителя Тохтамыш-хана в 1380-1390-ых годах была войной не только двух честолюбцев, но и была чисто экономической войной за то, кто будет получать главный доход от Великого Шелкового пути. При этом цели у Тохтамыша и Тамерлана были разные. Тохтамыш хотел присоединить территории Хорезма и Азербайджана, которые Тамерлан, по его мнению, незаконно отобрал у Золотой орды. Тамерлан же не хотел присоединять к себе огромные пространства Золотой орды, его целью было улучшение экономики своей страны. Даже захватив города и территорию Золотой орды, Тамерлан ее легко отпустил, так как территориальные приобретения в данном направлении не являлись целью Тамерлана. Для своей победы Тамерлан, куда более искушенный в военном деле и экономике, стал наносить удары по золотоордынским городам. После того, как он обеспечил внутриполитическую стабильность для иностранных купцов, Тамерлану оставалось только уничтожить соперника, то есть экономику Золотой орды, что он и совершил в 1390-ых годах, когда разрушил столицу Золотой орды и ограбил многие другие более мелкие города. В итоге из-за походов Тамерлана и разрушений золотоордынских городов, большая часть маршрутов Великого Шелкового пути переместилась на юг на территорию государства Тамерлана. И Улус Джучи XV века, лишившийся большого количества городского населения, стала деградировать. Экономика стала более примитивной, уменьшился как товарооборот с другими странами, так и внутри самого улуса Джучи. Правители стали выпускать гораздо меньше монет, исходя из того, что уменьшился спрос на деньги. Хозяйство стало приобретать все более натуральный характер.

Вследствие деградации городов и после вторжения Тамерлана междоусобицы в улусе Джучи разгорелись с новой силой. В основном противоборство шло по линии Едыге-Тохтамыш. Также стоит отметить, что Едыге был женат на Джаныке, дочери Тохтамыша. Также известно, что Едыге был женат на дочери Куйурчука, от которой имел сына Мансура.

В 1398 году Тохтамыш вместе с войсками литовского князя Витовта выступил против Тимур-Кутлука. За военную поддержку Тохтамыш обещал отдать во владение Витовту все русские княжества.

Тимур-Кутлук, имея меньшую армию, начал переговоры с Витовтом, обещая ему признать его власть («стать сыном»), чеканить монеты с именем Витовта и платить дань. Данные переговоры имели только одну цель: Тимур-Кутлук ждал подхода войск Едыге. Получив подкрепления, Тимур-Кутлук, свернул переговоры. 12 августа 1399 года сошлись две армии на реке Ворксле. Армия Витовта имевшая уже в те времена артиллерию, потерпела сокрушительное поражение. Тохтамыш бежал, Витовт же с помощью сына Мамая кията Мансура выбрался из лесов, за что Мансур впоследствии был награжден владениями и стал основателем рода Глинских. После этого поражения Тохтамыш прятался от Едыге, воюя с ним партизанскими методами, путем мелких стычек. Под конец жизни Тохтамыш помирился с Тамерланом, прислав к нему своего посла Кара-ходжу аргына (предок большей части казахских аргынов). Тохтамыш был убит в Сибири во второй половине 1400-ых годов. Его дети эмигрировали и жили в разных государствах, часть ушла в Великое Княжество Литовское, где на стороне литовцев и поляков участвовала в знаменитой Грюнвальдской битве 1410 года, где были побеждены тевтонские рыцари. Часть проживала в русских княжествах, часть в городах Средней Азии.

Жаксылык САБИТОВ